
Les espèces exotiques envahissantes (EEE) sont des espèces introduites en dehors de leur aire de répartition naturelle, capables de s’établir durablement et de perturber les écosystèmes locaux.
Dans le cadre du plan Rhône-Saône 2021-2027, un nouvel objectif opérationnel prévoyait l’élaboration d’une stratégie relative aux EEE de l’axe Rhône. La Fédération des Conservatoires d’espaces naturels, en tant qu’animatrice de la stratégie zones humides et du réseau d’acteurs des espaces naturels Rhône & Saône, s’est vu confier ce travail.
Finalisée en 2025, la stratégie entre dans un premier cycle de mise en œuvre de six ans. Elle vise notamment à renforcer la coordination entre les acteurs et harmoniser les actions afin d’améliorer l’efficacité des interventions.
- En savoir plus sur les espèces exotiques envahissantes.
Actualités
Journée de lancement de la stratégie EEE de l’axe Rhône
📆 le mardi 23 juin 2026 à la Maison de l’Environnement de Lyon
Préprogramme
- Présentation de la stratégie, de son cadre et de ses premières actions.
- Ateliers thématiques autour d’actions et/ou de sujets en lien avec la stratégie.
- Interventions et retours d’expérience.
Appel à contributions 📝
Un court formulaire est mis à disposition afin de recueillir des idées de sujets/questions à aborder, ainsi que des propositions d’intervention (à remplir d’ici le 17 avril).
La stratégie relative aux espèces exotiques envahissantes de l’axe Rhône
La stratégie relative aux espèces exotiques envahissantes de l’axe Rhône est désormais disponible (version du 19/12/2025) !

Retrouvez la présentation de la stratégie dans le replay du webinaire du 15 décembre 2025 :
- Replay partie 1 : présentation de la stratégie.
- Replay partie 2 : articulation avec les actions et programmes des partenaires.
- Support de présentation.
L’objectif général de cette stratégie est de proposer un cadre de travail pour améliorer la prévention, la gestion et la sensibilisation aux espèces exotiques envahissantes sur l’axe Rhône. Pour cela, la coordination entre les acteurs et la cohérence des actions menées à l’échelle locale le long de l’axe Rhône sont assurées via la promotion des échanges entre acteurs, la définition de priorités partagées et la mise en place d’actions support et d’outils communs.
Enjeux de la stratégie
Les espèces exotiques envahissantes sont l’une des cinq principales causes de l’érosion de la biodiversité. Les grands axes fluviaux, comme le Rhône, constituent pour elles de véritables couloirs de dispersion, offrant des milieux pionniers régulièrement renouvelés par les crues, l’érosion ou les dépôts sédimentaires. Ces dynamiques naturelles, combinées aux activités humaines (transport, infrastructures, gestion hydraulique, chantiers), facilitent leur prolifération. Les milieux aquatiques et humides associés au fleuve sont ainsi particulièrement vulnérables, et les EEE y menacent la biodiversité, certains usages et parfois la santé humaine.
C’est dans ce cadre que 4 principaux enjeux ont été identifiés pour la stratégie :
- La conservation des milieux aquatiques et rivulaires du Rhône : les capacités de résistance et de résilience ;
- L’efficacité des actions portées sur les EEE sur l’axe Rhône ;
- Le maintien des services écosystémiques rendus par les milieux aquatiques et rivulaires ;
- L’amélioration des connaissances sur les EEE présentes sur l’axe Rhône.
Echelle géographique
La stratégie EEE a pour ambition de prendre en compte tout le lit majeur du Rhône (périmètre du plan Rhône) ainsi que de faire de la veille sur les EEE présentes sur les affluents. Les affluents sont concernés en tant que zones de sources de potentielles nouvelles espèces exotiques ou de milieux à risque d’infestation en provenance du Rhône. La Saône, qui fait l’objet d’un travail similaire mené par l’EPTB Saône & Doubs, est intégrée aux réflexions afin d’articuler les deux démarches.
Milieux concernés
Le Rhône est ses annexes fluviales (comme les lônes) ; ainsi que les zones humides.
Taxons pris en compte
- Flore : flore vasculaire des milieux aquatiques et humides, à l’exclusion de la bryoflore.
- Faune : faune aquatique et semi-aquatique, à l’exclusion des pathogènes, de l’avifaune, de l’arachnofaune et de l’entomofaune.
Découpage opérationnel
La taille du réseau hydrographique et le rôle déterminant des facteurs latitudinaux et altitudinaux le long du Rhône ont conduit à l’identification de trois entités géographiques distinctes (tronçons) :
- Le Rhône amont : de la frontière suisse à Lyon (intégrant l’agglomération lyonnaise) ;
- Le Rhône médian : du sud de Lyon à Bollène ;
- Le Rhône aval : de Bollène au delta du Rhône inclus.
Une stratégie globale pour définir la gestion à l’échelle locale
La stratégie a pour vocation d’être opérationnelle, sans portée règlementaire, mais portant les ambitions des acteurs du fleuve sur la gestion des EEE. Elle s’adressera aux collectivités territoriales, structures gemapiennes, syndicats de rivières et autres gestionnaires des milieux naturels confrontés à la problématique. Elle constitue un premier travail destiné à s’intégrer dans une démarche plus large à l’avenir, via l’articulation avec des initiatives similaires sur les territoires des affluents.
- À l’échelle du fleuve Rhône : la stratégie apportera un cadre stratégique sur les outils et les connaissances disponibles à l’échelle du Rhône.
- À l’échelle du tronçon : la déclinaison de la stratégie à l’échelle du tronçon permettra d’apporter un appui technique à la gestion par l’identification des secteurs prioritaires et les opportunités de collaboration.
- À l’échelle locale : la déclinaison locale de la stratégie en plan de gestion précis et opérationnel sera de la responsabilité du gestionnaire.
Ce travail s’appuie sur différents comités :
- Le comité de pilotage, qui valide les orientations et les productions. Il est composé de : l’Agence de l’eau Rhône Méditerranée Corse, la DREAL de bassin, les Régions Auvergne-Rhône-Alpes, Occitanie, Sud-PACA et Bourgogne-Franche-Comté, CNR, EDF, VNF, le SGAR, l’OFB et la FCEN.
- Le comité technique, qui travaille sur le cadre méthodologique et technique de la stratégie. Il est composé des membres du comité de pilotage auxquels s’ajoutent le réseau des gestionnaires d’espaces naturels (Conservatoires d’espaces naturels, collectivités, établissements publics, syndicats mixtes, associations…), les Conservatoires botaniques nationaux, les Fédérations de pêche, de chasse et d’usagers, les DREAL, les FREDON, les Agences régionales de santé, les Agences régionales de la biodiversité, les scientifiques…
- Les trois comités de tronçon, qui précisent la mise en œuvre des actions et sous-actions sur le territoire. Ils sont composés des acteurs impliqués localement sur la thématique des EEE.
Retour sur l’élaboration de la stratégie
Pour construire cette stratégie, la Fédération des Conservatoires d’espaces naturels s’est appuyée sur un réseau d’acteurs rassemblant plus de 300 structures concernées par la problématique des EEE. Les besoins, attentes et enjeux du territoire ont été identifiés grâce à une démarche collective via des réunions, ateliers et enquêtes. Ce travail partenarial a permis de coconstruire un plan d’action adapté aux enjeux du lit majeur du Rhône.
Ce travail a été réalisé en deux étapes :
- Une phase d’élaboration (2022-2023), visant à préciser les objectifs, définir les actions nécessaires, en planifier la mise en œuvre et identifier les espèces prioritaires à l’échelle de l’axe Rhône.
- Une phase de préfiguration (2024-2025), consacrée à l’identification des acteurs à mobiliser, à l’état des connaissances sur les EEE, à la liste des espèces avérées ou potentielles, et à l’analyse des besoins permettant de définir les enjeux de la stratégie.
Cette première phase de cadrage a été réalisée de septembre 2022 à décembre 2023.
Etat des lieux des connaissances et des besoins
- Etat des lieux des connaissances : stratégie et réseaux existants, acteurs impliqués sur la thématique des EEE, travaux scientifiques et données disponibles. Ce travail s’appuie sur les démarches réalisées au niveau local et régional.
- Diagnostic social : identification des attentes vis-à-vis de la stratégie, des besoins liés aux EEE et des spécificités (espèces et secteurs à enjeu) de chaque tronçon via une enquête auprès des acteurs locaux et gestionnaires (voir la restitution de l’enquête) et des ateliers territoriaux réalisés sur chaque tronçon (synthèse des ateliers).
- Diagnostic biologique : catalogue des espèces exotiques présentes ou susceptibles d’arriver rapidement sur le territoire de la stratégie (à partir des listes de référence et d’une enquête auprès des gestionnaires) et cartographie des espèces identifiées à partir des données d’occurrence disponibles.
Recommandations pour élaborer la stratégie
L’étude de préfiguration de la stratégie EEE de l’axe Rhône s’est achevée en décembre 2023 avec la publication d’un guide d’aide à la rédaction de la stratégie. Ce guide prend la forme d’un cahier des charges pour le travail d’élaboration et précise la structure du document attendu, les pressions et enjeux identifiés et des propositions concernant les objectifs et les actions à déployer. Il formule également des recommandations sur la mise en œuvre et l’animation de la stratégie.
Un webinaire de restitution a été organisé le 19 décembre 2023, à l’issue de ce travail préparatoire de 16 mois, regroupant 70 participants. L’enregistrement est disponible à ce lien.
Durant cette phase, les acteurs de la stratégie ont été invités à participer activement à l’élaboration du plan d’action via :
- le comité technique du 28 mai 2024 qui a permis de préciser les action et leur articulation (voir support et compte rendu) ;
- la mise à disposition d’un dossier partagé comprenant notamment les fiches action proposées pour recueillir les remarques et proposition de chaque acteur ;
- la réalisation de « réunions action » pour finaliser les fiches action ;
- le comité technique du 16 mai 2025 qui a permis de prioriser les actions et d’organiser leur mise en œuvre dans le temps (voir support et compte rendu) ;
- les trois comités de tronçon organisés en juin 2025 qui ont permis d’identifier les acteurs à impliquer dans chaque sous-action (voir support et compte rendu).
En parallèle, les experts du réseau ont été sollicités dans le cadre de la définition d’une méthode d’élaboration de listes d’espèces adaptées aux besoins de la stratégie (voir support et replay du webinaire de présentation de la méthode qui s’est tenu le 14 octobre 2024). Cette méthode a été appliquée à la flore, puis à la faune, à l’échelle du fleuve.
Les avancées dans l’élaboration de la stratégie ont présentées chaque année lors d’un webinaire dédié :
- Webinaire du 19 décembre 2024 : point d’étape sur le plan d’action et premiers résultats pour les listes (voir support et replay).
- Webinaire du 15 décembre 2025 : retour sur la construction de la stratégie ; plan d’action retenu et zoom sur les actions prévues pour 2026 ; listes d’espèces cibles ; intégration de la stratégie aux programmes des partenaires du plan Rhône-Saône (voir support, replay 1 et replay 2).
- Principaux documents produits :
- Stratégie relative espèces exotiques envahissantes de l’axe Rhône (version du 19/12/2025)
- État des lieux des connaissances générales sur les espèces exotiques envahissantes du fleuve Rhône – Synthèse de l’analyse documentaire – Mars 2023
- Guide d’aide à la rédaction de la stratégie de gestion des espèces exotiques envahissantes sur le Rhône – Décembre 2023
- Pour aller plus loin :
- Les EEE des bassins Rhône-Méditerranée et Corse
- Centre de ressources espèces exotiques envahissantes
- Contact :
- Marie Chambonnière, chargée de mission EEE axe Rhône, marie.chambonniere@reseau-cen.org – 06 23 35 49 82
- Fédération des Conservatoires d’espaces naturels – Maison Forte, 2 rue des Vallières 69390 Vourles




